MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus intermedius B196

Total Repeats: 43455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022246	TTATTT	2	12	5	16	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022246	CAA	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022246	ATTT	2	8	123	130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022246	ACT	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022246	AAT	2	6	201	206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022246	AGG	2	6	213	218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022246	T	6	6	219	224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022246	A	8	8	282	289	100 %	0 %	0 %	0 %	538379296
9	NC_022246	TTAA	2	8	321	328	50 %	50 %	0 %	0 %	538379296
10	NC_022246	CTT	2	6	354	359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379296
11	NC_022246	ATT	2	6	377	382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379296
12	NC_022246	TCA	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379296
13	NC_022246	AAT	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379296
14	NC_022246	AAG	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
15	NC_022246	CAA	2	6	493	498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379296
16	NC_022246	TCC	2	6	530	535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538379296
17	NC_022246	CAA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379296
18	NC_022246	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379296
19	NC_022246	TGG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538379296
20	NC_022246	CTA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379296
21	NC_022246	AT	3	6	752	757	50 %	50 %	0 %	0 %	538379296
22	NC_022246	CTG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379296
23	NC_022246	ATTG	2	8	851	858	25 %	50 %	25 %	0 %	538379296
24	NC_022246	GAAA	2	8	880	887	75 %	0 %	25 %	0 %	538379296
25	NC_022246	AAG	2	6	898	903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
26	NC_022246	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	538379296
27	NC_022246	GAA	2	6	993	998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
28	NC_022246	CCA	2	6	1044	1049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538379296
29	NC_022246	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
30	NC_022246	TC	3	6	1188	1193	0 %	50 %	0 %	50 %	538379296
31	NC_022246	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379296
32	NC_022246	CAAAT	2	10	1270	1279	60 %	20 %	0 %	20 %	538379296
33	NC_022246	ACA	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379296
34	NC_022246	GAT	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379296
35	NC_022246	TAGAAA	2	12	1534	1545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538379296
36	NC_022246	A	6	6	1550	1555	100 %	0 %	0 %	0 %	538379296
37	NC_022246	GAT	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379296
38	NC_022246	A	6	6	1585	1590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022246	CA	3	6	1658	1663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022246	ACT	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022246	TAA	2	6	1693	1698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022246	ATA	2	6	1706	1711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022246	TAA	2	6	1741	1746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
44	NC_022246	ATTT	2	8	1749	1756	25 %	75 %	0 %	0 %	538379297
45	NC_022246	ACC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538379297
46	NC_022246	ATTG	2	8	1855	1862	25 %	50 %	25 %	0 %	538379297
47	NC_022246	TAA	2	6	1926	1931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
48	NC_022246	CTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379297
49	NC_022246	T	6	6	1964	1969	0 %	100 %	0 %	0 %	538379297
50	NC_022246	TGT	2	6	1975	1980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538379297
51	NC_022246	ATA	2	6	1997	2002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
52	NC_022246	AGTA	2	8	2113	2120	50 %	25 %	25 %	0 %	538379297
53	NC_022246	ATT	2	6	2156	2161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379297
54	NC_022246	GTC	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379297
55	NC_022246	AGA	2	6	2286	2291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379297
56	NC_022246	GAA	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379297
57	NC_022246	TGT	2	6	2323	2328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538379297
58	NC_022246	GAT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379297
59	NC_022246	AAT	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
60	NC_022246	TCT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379297
61	NC_022246	TAGT	2	8	2616	2623	25 %	50 %	25 %	0 %	538379297
62	NC_022246	GAA	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379297
63	NC_022246	CAG	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379297
64	NC_022246	TGA	2	6	2809	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379297
65	NC_022246	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379298
66	NC_022246	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538379298
67	NC_022246	A	6	6	2926	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	538379298
68	NC_022246	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379298
69	NC_022246	A	6	6	3036	3041	100 %	0 %	0 %	0 %	538379298
70	NC_022246	T	6	6	3070	3075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022246	ATC	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379299
72	NC_022246	T	6	6	3164	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
73	NC_022246	TCT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379299
74	NC_022246	T	6	6	3356	3361	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
75	NC_022246	TAG	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379299
76	NC_022246	TTTGT	2	10	3403	3412	0 %	80 %	20 %	0 %	538379299
77	NC_022246	ACA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379299
78	NC_022246	TAA	2	6	3429	3434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379299
79	NC_022246	T	7	7	3489	3495	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
80	NC_022246	TGA	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379299
81	NC_022246	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379299
82	NC_022246	T	7	7	3571	3577	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
83	NC_022246	CCT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_022246	TAA	2	6	3600	3605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022246	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022246	AAT	2	6	3667	3672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022246	ATTGA	2	10	3695	3704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022246	CAG	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379300
89	NC_022246	TTTA	2	8	3776	3783	25 %	75 %	0 %	0 %	538379300
90	NC_022246	TCA	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379300
91	NC_022246	CAA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379300
92	NC_022246	A	6	6	4180	4185	100 %	0 %	0 %	0 %	538379300
93	NC_022246	AAAGAT	2	12	4200	4211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538379300
94	NC_022246	A	6	6	4237	4242	100 %	0 %	0 %	0 %	538379300
95	NC_022246	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379300
96	NC_022246	AGA	2	6	4295	4300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
97	NC_022246	A	6	6	4303	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	538379300
98	NC_022246	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379300
99	NC_022246	ATA	2	6	4390	4395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379300
100	NC_022246	GAA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
101	NC_022246	GAT	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379300
102	NC_022246	TGAA	2	8	4531	4538	50 %	25 %	25 %	0 %	538379300
103	NC_022246	AGC	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379300
104	NC_022246	TTA	2	6	4575	4580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379300
105	NC_022246	ACTT	2	8	4590	4597	25 %	50 %	0 %	25 %	538379300
106	NC_022246	AAG	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
107	NC_022246	CAC	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538379300
108	NC_022246	AGC	2	6	4658	4663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379300
109	NC_022246	ATG	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379300
110	NC_022246	GAA	2	6	4779	4784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
111	NC_022246	AT	3	6	4793	4798	50 %	50 %	0 %	0 %	538379300
112	NC_022246	ATGA	2	8	4858	4865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022246	A	6	6	4908	4913	100 %	0 %	0 %	0 %	538379301
114	NC_022246	GAT	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379301
115	NC_022246	GA	3	6	4947	4952	50 %	0 %	50 %	0 %	538379301
116	NC_022246	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379301
117	NC_022246	CAA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379301
118	NC_022246	ATGA	2	8	5111	5118	50 %	25 %	25 %	0 %	538379301
119	NC_022246	TTAT	2	8	5181	5188	25 %	75 %	0 %	0 %	538379301
120	NC_022246	GAT	2	6	5189	5194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379301
121	NC_022246	CTG	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379301
122	NC_022246	ATT	2	6	5267	5272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379301
123	NC_022246	ACA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379301
124	NC_022246	ATT	2	6	5342	5347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379301
125	NC_022246	AGA	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379301
126	NC_022246	AC	3	6	5397	5402	50 %	0 %	0 %	50 %	538379301
127	NC_022246	ATT	2	6	5430	5435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379301
128	NC_022246	AACA	2	8	5454	5461	75 %	0 %	0 %	25 %	538379301
129	NC_022246	CAA	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379301
130	NC_022246	ATT	2	6	5493	5498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
131	NC_022246	ATT	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
132	NC_022246	AG	3	6	5618	5623	50 %	0 %	50 %	0 %	538379302
133	NC_022246	TGATT	2	10	5681	5690	20 %	60 %	20 %	0 %	538379302
134	NC_022246	GAA	2	6	5703	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379302
135	NC_022246	GAT	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379302
136	NC_022246	T	7	7	5757	5763	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
137	NC_022246	T	6	6	5776	5781	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
138	NC_022246	T	6	6	5801	5806	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
139	NC_022246	GCT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379302
140	NC_022246	T	7	7	5860	5866	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
141	NC_022246	TTAATT	2	12	5878	5889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
142	NC_022246	TGATT	2	10	5933	5942	20 %	60 %	20 %	0 %	538379302
143	NC_022246	T	6	6	6066	6071	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
144	NC_022246	TGA	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379302
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146	NC_022246	TAC	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379302
147	NC_022246	A	7	7	6201	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
148	NC_022246	A	6	6	6223	6228	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
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151	NC_022246	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
152	NC_022246	T	6	6	6322	6327	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
153	NC_022246	AAAT	2	8	6332	6339	75 %	25 %	0 %	0 %	538379302
154	NC_022246	TGA	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379302
155	NC_022246	A	6	6	6394	6399	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
156	NC_022246	TAAA	2	8	6403	6410	75 %	25 %	0 %	0 %	538379302
157	NC_022246	AGC	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379302
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160	NC_022246	CT	3	6	6581	6586	0 %	50 %	0 %	50 %	538379302
161	NC_022246	T	6	6	6618	6623	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
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164	NC_022246	TTC	2	6	6698	6703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379302
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167	NC_022246	A	6	6	6841	6846	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
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169	NC_022246	TC	3	6	6911	6916	0 %	50 %	0 %	50 %	538379302
170	NC_022246	TGT	2	6	6965	6970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538379302
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172	NC_022246	TAAAT	2	10	7148	7157	60 %	40 %	0 %	0 %	538379302
173	NC_022246	A	6	6	7171	7176	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
174	NC_022246	AG	3	6	7183	7188	50 %	0 %	50 %	0 %	538379302
175	NC_022246	AG	3	6	7238	7243	50 %	0 %	50 %	0 %	538379302
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178	NC_022246	TA	3	6	7314	7319	50 %	50 %	0 %	0 %	538379302
179	NC_022246	AGA	2	6	7325	7330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379302
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183	NC_022246	A	7	7	7616	7622	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
184	NC_022246	ATT	3	9	7635	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
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207	NC_022246	GA	3	6	8742	8747	50 %	0 %	50 %	0 %	538379302
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210	NC_022246	ATT	2	6	8809	8814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
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212	NC_022246	TTGA	2	8	8868	8875	25 %	50 %	25 %	0 %	538379302
213	NC_022246	A	6	6	8898	8903	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
214	NC_022246	AGA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379302
215	NC_022246	A	7	7	8939	8945	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
216	NC_022246	AAG	2	6	8967	8972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379302
217	NC_022246	A	6	6	9027	9032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
218	NC_022246	ATA	2	6	9040	9045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
219	NC_022246	TAT	2	6	9093	9098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379303
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239	NC_022246	AT	3	6	9652	9657	50 %	50 %	0 %	0 %	538379304
240	NC_022246	ATT	2	6	9699	9704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379305
241	NC_022246	ACAA	2	8	9705	9712	75 %	0 %	0 %	25 %	538379305
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252	NC_022246	TCAA	2	8	10153	10160	50 %	25 %	0 %	25 %	538379306
253	NC_022246	CTG	2	6	10253	10258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379306
254	NC_022246	AAGT	2	8	10399	10406	50 %	25 %	25 %	0 %	538379306
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256	NC_022246	TCTA	2	8	10424	10431	25 %	50 %	0 %	25 %	538379306
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258	NC_022246	TCT	2	6	10562	10567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379306
259	NC_022246	AT	3	6	10576	10581	50 %	50 %	0 %	0 %	538379306
260	NC_022246	CAG	2	6	10584	10589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379306
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262	NC_022246	A	6	6	10640	10645	100 %	0 %	0 %	0 %	538379306
263	NC_022246	ATA	2	6	10650	10655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379306
264	NC_022246	CAAT	2	8	10741	10748	50 %	25 %	0 %	25 %	538379306
265	NC_022246	AAC	2	6	10765	10770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379306
266	NC_022246	A	6	6	10790	10795	100 %	0 %	0 %	0 %	538379306
267	NC_022246	CTAT	2	8	10851	10858	25 %	50 %	0 %	25 %	538379306
268	NC_022246	CAAA	2	8	10892	10899	75 %	0 %	0 %	25 %	538379306
269	NC_022246	ATG	2	6	10977	10982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379306
270	NC_022246	TATCT	2	10	11011	11020	20 %	60 %	0 %	20 %	538379306
271	NC_022246	AAT	2	6	11030	11035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379306
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